こっちがWindows 8.1におけるIE11の表示。

こっちが同じくWindows 8.1におけるGoogle Chromeの表示です。

Windows 8.1のIE11では従来よりMSゴシック系のフォントが選ばれる割合が減っているように思えます。MSゴシック系のフォントはブラウザ倍率変更に弱い（ビットマップ表示からアウトライン表示にいきなり変わって違和感がある）傾向がありましたが、Windows 8.1のIE11での表示ではちょうどiOSやAndroid端末のように、ブラウザ倍率変更にフォントがスムーズに追従してよい感じです。

ただしフォントとして明示的にMSゴシックを指定しているサイトはこの限りではないようです。たとえばNTTドコモのサイト（http://www.nttdocomo.co.jp）はCSSで明示的にMS Pゴシックを指定しているため、Windows 8.1のIE11においてもMSゴシックの表示となります。

Office系はともかくブラウザでの表示においては、もうMSゴシック系はいいんじゃないかとも思ってしまいますがいかがでしょうか。